Claudia Andujar nació en Neuchâtel (Suiza) en 1931 y posteriormente se trasladó a Oradea, en la frontera entre Rumanía y Hungría, donde vivía su familia paterna, de origen judío. En 1944, debido a la persecución de los judíos durante la Segunda Guerra Mundial, huyó con su madre a Suiza y, más tarde, emigró a Estados Unidos. En Nueva York estudió pintura y trabajó como intérprete en las Naciones Unidas.
En 1955, Andujar llegó a São Paulo (Brasil) para reencontrarse con su madre y decidió establecerse en el país, donde comenzó su carrera como fotógrafa. Sin hablar portugués, la fotografía se convirtió en una herramienta, un medio de contacto entre ella y el pueblo brasileño. Durante las décadas siguientes, colaboró con revistas brasileñas e internacionales como Life, Aperture, Look, Claudia, Quatro Rodas y Setenta. En 1966 se unió al primer equipo de fotógrafos de la revista Realidade.
En 1971 recibió una beca de la Fundación Guggenheim para investigar sobre el pueblo Yanomami de la Amazonía brasileña. Entre 1978 y 2000 trabajó para la Comissão Pró-Yanomami, una ONG con la que coordinó la campaña para la demarcación del territorio Yanomami, que fue oficialmente reconocido por el gobierno brasileño en 1993.
En el año 2000 fue galardonada con el Premio Anual a la Libertad Cultural [Fotografía], otorgado por la Fundación Lannan de Nuevo México (EE.UU.), como defensora de los derechos humanos. En 2003 recibió el Premio Severo Gomes, concedido por la Comisión Teotônio Vilela de Derechos Humanos (São Paulo, Brasil), y en 2005, el premio a la Mejor Exposición de Fotografía de la APCA (Asociación Paulista de Críticos de Arte), por su muestra individual A Vulnerabilidade do Ser [La vulnerabilidad del ser], presentada en la Pinacoteca do Estado, São Paulo.
En 2008 fue homenajeada por el Ministerio de Cultura de Brasil por sus logros artísticos y culturales. En 2018 fue distinguida con la Medalla Goethe, en Weimar (Alemania). En 2024 recibió el grado de Oficial de la Orden de las Artes y las Letras, una de las cuatro principales distinciones otorgadas por las órdenes ministeriales de la República Francesa.